All conferences


2017


  1. Burdukiewicz M., Rödiger S., Gąsior-Głogowska M., Mackiewicz D., Kotulska M. 2017, Computational and experimental validation of amyloid databases. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-27 July 2017, Prague, Czech Republic.

  2. Mackiewicz D., Posacki P., Burdukiewicz M., Błażej P. 2017, The problem of recombination suppression in evolution of sex chromosomes. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-27 July 2017, Prague, Czech Republic.

  3. Mackiewicz P., Błażej P., Grabińska M., Wnętrzak M., Mackiewicz D. 2017, Optimization of mutational pressure in bacterial genomes according to costs of amino acid replacement. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 21-27 July 2017, Prague, Czech Republic.

  4. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2017, The Application of Multi-objective Approach in the Optimization of the Genetic Code. X Symposium of the Polish Bioinformatics Society 27-29 September 2017, Uniejów, Poland. Book of abstracts pp. 42

  5. Wnętrzak M., Błażej P., Grabińska M., Mackiewicz P. 2017, Representations of Markov processes in biological optimization problems. Gdańsk Summer School of Advanced Science on Algorithms for Discrete Optimization 5-12 September 2017, Gdańsk, Poland.

  6. Wnętrzak M., Błażej P., Grabińska M., Mackiewicz P. 2017, Representations of Markov processes in biological optimization problems. The 25th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB), 21-25 July 2017, Prague, The Czech Republic.
    [Download]

2016


  1. Baca M., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Urbanowski M., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2016, Estimation of cave bear extinction including the youngest specimen confirmed genetically. The 22nd International Cave Bear Symposium 21-25 September 2016, Kletno, Polska. Programme and abstracts pp. 19-20

  2. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, The influence of selection at the amino acid level on the synonymous codons usage. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Genomes pp. 9

  3. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, Selection at the amino acid level influences the synonymous codons usage bias. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  4. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, Selection at the amino acid level as one of the forces behind the synonymous codons usage bias. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 193

  5. Błażej P., Wnętrzak M., Mackiewicz P. 2016, The impact of the crossover operator on the results of evolutionary-based algorithms in the problem of the genetic code optimization. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 59

  6. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: a novel predictor of amyloidogenicity. European Student Council Symposium ESCS 2016 3 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts pp. 7

  7. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: n-gram analysis of amyloids. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 24

  8. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P. 2016, Biogram: standardization of biological n-gram analysis in R. The CHARME of standardisation in life sciences 21-22 June 2016, Warsaw, Polska. Abstracts pp. 20-21

  9. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, Prediction of malarial signal peptides. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 270

  10. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2016, N-gram analysis of biological sequences in R. European R Users Meeting eRum 2016 12-14 October 2016, Poznań, Polska. Book of Abstracts pp. 64

  11. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2016, Biogram: a toolkit for biological n-gram analysis. Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  12. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: a novel predictor of amyloidogenicity. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Proteins pp. 1

  13. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, AmyloGram: analysis and prediction of amyloids using n-grams. Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics BIO 2016 13–16 September 2016, Wrocław, Polska. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2016, Abstracts of the BIO 2016 Congress pp. 164

  14. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2016, dpcR: web server and R package for analysis of digital PCR experiments. Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  15. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, SignalHsmm: prediction of malarial signal peptides. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  16. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M. 2016, Prediction of amyloidogenicity based on the n-gram analysis. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 65-74

  17. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2016, Import of nuclear-encoded proteins into the photosynthetic organelles of Paulinella chromatophora. The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, ICES 2016 10-16 September 2016, Kyoto, Japan. Program Book pp. 32

  18. Kramer T., Rödiger S., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Menschikowski M., Lehmann W. 2016, Absolute Quantification of Nucleic Acids on a Planar Droplet Digital PCR Array Innovation Forum Senftenberg 1-2 June 2016, Senftenberg, Germany.
    [Download]

  19. Kuźnik-Kowalska E., Strzała T., Mackiewicz P., Proćków M., Pokryszko B. 2016, Molekularna analiza filogeograficzna Discus perspectivus (Megerle von Muehlfeld, 1818). XXXII Krajowe Seminarium Malakologiczne 13-15 październik 2016 , Spała, Polska. Maltz TK, Kałuski T, Sulikowska-Drozd A (red.) Problemy współczesnej malakologii. Bogucki Wydawnictwo Naukowe, Poznań pp. 42

  20. Mackiewicz D. 2016, The influence of chromosome position on human gene evolution The 5th Polish Congress of Genetics 19-22 September.2016, Łódź, Polska. Program i materiały kongresowe pp. 194

  21. Pawlik K., Mackiewicz P., Kotowska M., Tobiasz A., Kozub K., Korzeniowska-Kowal A. 2016, Microbiological Resources and Bioinformatic Tools at MultiGenBank Database. Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics BIO 2016 13–16 September 2016, Wrocław, Polska. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2016, Abstracts of the BIO 2016 Congress pp. 170

  22. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Mackiewicz P. 2016, Phylogeography of cave bear (Ursus ingressus) from Central and Eastern Europe based on ancient DNA. The 22nd International Cave Bear Symposium 21-25 September 2016, Kletno, Polska. Programme and abstracts pp. 31-32

  23. Posacki P., Mackiewicz D., Mackiewicz P. 2016, The influence of sex determination system and faithfulness of pairs on sex chromosome evolution The 5th Polish Congress of Genetics 19-22 September.2016, Łódź, Polska. Program i materiały kongresowe pp. 273

  24. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Proćków J., Mackiewicz P. 2016, Ongoing speciation and gene flow between taxonomically challenging Trochulus species complex (Gastropoda: Hygromiidae). World Congress of Malacology - The 19th International Congress of Unitas Malacologica 18-24 July 2016, Penang, Malaysia.

  25. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2016, Climate-related shell variation in Trochulus striolatus (Gastropoda: Hygromiidae) and its implications for subspecies taxonomy. World Congress of Malacology - The 19th International Congress of Unitas Malacologica 18-24 July 2016, Penang, Malaysia.

  26. Proćków M., Kuźnik-Kowalska E., Mackiewicz P. 2016, Plastyczność fenotypowa i brak barier rozrodczych między dwoma morfologicznymi formami Trochulus hispidus (Gastropoda: Hygromiidae). XXXII Krajowe Seminarium Malakologiczne 13-15 październik 2016 , Spała, Polska. Maltz TK, Kałuski T, Sulikowska-Drozd A (red.) Problemy współczesnej malakologii. Bogucki Wydawnictwo Naukowe, Poznań pp. 57

  27. Ratajczak U.Urszula , Stefaniak K., Nadachowski A., Mackiewicz P. 2016, Quaternary bone remains of Saiga sp. from Eurasia. The 22nd Quaternary seminar 24-25 November 2016, Brno, Czech Republic. Kana V, Calabkova G, Ivanov M, Brezina J. (eds.) Abstract book pp. 32

  28. Ratajczak U.Urszula , Shpansky A. V., Malikov D. G., Stefaniak K., Nadachowski A., Ridush B., Wojtal P., Krakhmalnaya T. V., Mackiewicz P. 2016, Quaternary skulls of the saiga from Eastern Europe and Siberia. Saiga borealis versus Saiga tatarica – one species or two? The 3rd Young Natural History Scientists Meeting 2-6 February 2016 , Paris, France. Abstract Book pp. 32-33

  29. Rödiger S., Burdukiewicz M., Schierack P. 2016, R as an Environment for the Reproducible Analysis of DNA European R Users Meeting eRum 2016 12-14 October 2016, Poznań, Polska. Book of Abstracts pp. 65

  30. Schiebel J., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Weinreich J., Rödiger S., Schierack P. 2016, Investigation of E. coli pathotypes for biofilm formation in association with their phenotypic and genotypic characteristics. 68. Joint Conference of the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 11-14 September 2016, Ulm, Germany.

  31. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The impact of crossover operator on the genetic code optimization performed by Evolutionary Algorithms. European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Data pp. 9

  32. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The immune system dynamics - computer simulation studies. The 9th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 28-30 September 2016, Białystok, Polska.

  33. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The model of immune system dynamics. German Conference on Bioinformatics GCB 2016 12-15 September 2016, Berlin, Germany. The Guide to GCB 2016 pp. 232

  34. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, Mathematical modelling of immune response. BioInformatics in Toruń – BIT16 16-18 June 2016, Toruń, Polska. Book of Abstracts pp. 61

  35. Ziobro J., Błażej P., Mackiewicz P. 2016, The increase in the antigen concentration European Conference on Computational Biology ECCB 2016 3-7 September 2016, Hague, Netherlands. Abstracts Systems pp. 38

2015


  1. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Predicting eukaryotic signal peptides using hidden Markov models. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 45-46

  2. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2015, Methods of Comparing Digital PCR Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 47-48

  3. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Rödiger S. 2015, dpcReport -- Mobile-Health analysis framework. Potsdam Days on Bioanalysis 1-2 November 2015, Potsdam, Germany.
    [Download]

  4. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Mackiewicz P., Kotulska M. 2015, N-gram analysis of amyloid data German Conference on Bioinformatics 2015 27-30 September 2015, Dortmund, Germany. Poster abstracts PeerJ PrePrints pp. 16

  5. Burdukiewicz M., Hugget J., Clement L., Jacobs B., Clement L., Schierack P., Rödiger S. 2015, The dpcR Package – a Framework for Analysis and Visualization of Digital PCR Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 54-55

  6. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Kotulska M., Mackiewicz P. 2015, biogram: a toolkit for n-gram analysis VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland. Book of Abstracts: K' pp. 12

  7. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Origin of plastids - still a challenge for phylogenetics VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland.

  8. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Protein trafficking in photosynthetic organelles of the armoured amoeba Paulinella Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 459

  9. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Bioinformatics studies of protein translocons in photosynthetic organelles of the testate amoeba Paulinella chromatophora. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 44

  10. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2015, Model importu białek do fotosyntetycznych organelli Paulinella chromatophora Technologie informatyczne dla badań i rozwoju. 20 lat Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego 25 czerwiec 2015 , Wrocław, Polska.

  11. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Application of Monte Carlo simulations and Metropolis-Hastings algorithm in analysis of mutation accumulation in three codon positions of protein coding sequences. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 48

  12. Kroczak A., Urantówka A. D., Mackiewicz P. 2015, Influence of methods and molecular markers’ selection on inferring phylogenetic relationships in the example of parrots from tribe Arini. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 51

  13. Kroczak A., Urantówka A. D., Mackiewicz P. 2015, Phylogenetic relationships within tribe Arini (parrots, Psittaciformes) based on various methods and molecular markers VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland.

  14. Mackiewicz D. 2015, Gene evolution in dependence on position on human chromosomes Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 50

  15. Mackiewicz P. 2015, Narzędzia bioinformatyczne w genotypowaniu mikroorganizmów Konferencja – Platforma MultiGenBank, Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu 14 grudnia 2015, Wrocław, Polska.

  16. Mackiewicz D., Cebrat S. 2015, Non-random distribution of recombination hotspot motifs in human genome. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 65-66

  17. Nadachowski A., Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Phylogeography of cave bear from Central and Eastern Europe in the light of ancient DNA studies 7th European Congress of Mammalogy 17-21 August 2015, Stockholm, Sweden. Abstracts pp. 107

  18. Pawlik K., Mackiewicz P., Tobiasz A., Kozub K., Korzeniowska-Kowal A. 2015, A microbiological module of MultiGenBank database The 6th International Weigl Conference on Microbiology 8–10 July 2015, Gdańsk, Poland. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2015, Abstracts pp. 80

  19. Pawlik K., Kotowska M., Korzeniowska-Kowal A., Mackiewicz P. 2015, SynKeD – Synthetic polyKetide Designer, a synthetic biology tool for computer aided designing of new polyketide products The 6th International Weigl Conference on Microbiology 8–10 July 2015, Gdańsk, Poland. Acta Biochimica Polonica, Supplement 2, 2015, Abstracts pp. 79

  20. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic studies of cave bear (Ursus ingressus) populations from Central and Eastern Europe The 21th International Cave Bear Symposium (ICBS), The Netherlands, 2015 10-13 September 2015, Hellevoetsluis, Netherlands. Program & Abstracts pp. 28

  21. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic diversity and evolution of cave bear from Central and Eastern Europe Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2015 12-16 July 2015, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 1046

  22. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Marciszak A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Obada T., Stankovic A., Mackiewicz P. 2015, Genetic studies of cave bear (Ursus ingressus) populations from Central and Eastern Europe. Polish Evolutionary Conference 24-26 September 2015, Poznań, Polska. Program & Abstracts pp. 68-69

  23. Posacki P., Mackiewicz P. 2015, Monte Carlo simulations of mammalian sex chromosomes evolution. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 47

  24. Proćków M., Strzała T., Kuźnik-Kowalska E., Proćków J., Mackiewicz P. 2015, Wielometodyczne podejście do identyfikacji Gatunków z rodzaju Trochulus (Gastropoda: Hygromiidae) XXXI Krajowe Seminarium Malakologiczne 22-25 wrzesień 2015, Wieliczka, Polska. Problemy współczesnej malakologii - Streszczenia pp. 38-39

  25. Rödiger S., Burdukiewicz M. 2015, Reproducible Analysis of DNA Amplification Experiments with an Open Source Software Environment The 67. Joint Conference of the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 27-30 September 2015, Münster, Germany.

  26. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A. 2015, Impact of Smoothing on Parameter Estimation in Quantitative DNA Amplification Experiments The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 31-32

  27. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A., Blagodatskikh K., Schierack P. 2015, RKWard: a Software Framework for Analysis of qPCR, dPCR, qIA and Melting Curve Data The 7th International qPCR & NGS Symposium 23-27 March 2015, Freising-Weihenstephan, Germany. Event Proceedings pp. 55

  28. Sobczyk P., Burdukiewicz M., Lauber C., Mackiewicz P. 2015, Quick Permutation Test: feature filtering of n-gram data. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 46-47

  29. Weigel C., Mackiewicz P. 2015, An extended set of oriC predictions for the Cyanobacteria DNA replication, chromosome segregation and cell division, EMBO Conference 27–31 July 2015, Egham, United Kingdom.

  30. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Genetic code optimality as a multiobjective optimization problem VII Konwersatorium Chemii Medycznej & VIII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego 17-19 September 2015, Lublin, Poland. Book of Abstracts: P pp. 20

  31. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Assessing the genetic code optimality using multiobjective optimization approach German Conference on Bioinformatics 2015 27-30 September 2015, Dortmund, Germany. Poster abstracts PeerJ PrePrints pp. 26

  32. Wnętrzak M., Błażej P., Mackiewicz P. 2015, Optimality of the canonical genetic code under multiobjective and mutually exclusive criteria. RECOMB 2015, the 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology 12-15 April 2015, Warsaw, Poland. Book of Abstracts pp. 50-51

2014


  1. Błażej P., Mackiewicz P., Grabińska M. 2014, Multiobjective optimization of mutation accumulation in bacterial genomes. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 78

  2. Burdukiewicz M., Sobczyk P., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Signal peptide prediction using hidden Markov models. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 74

  3. Burdukiewicz M., Kolenda R., Schierack P. 2014, Prevalence of Shiga toxin-producing, enterohemorrhagic and enteropathogenic Escherichia coli – a systematic review The 4. Joint Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM) and the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 5-8 October 2014, Dresden, Germany.

  4. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2014, Evolution of protein transport systems in primary plastids and Paulinella chromatophores. Plant Molecular Cytogenetics in Genomic and Postgenomic Era 23-24 September 2014, Katowice, Poland. Abstract Book pp. 43

  5. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Searching for mutational matrices in bacterial genomes. BIO 2014 Congress, 1st Congress of the Polish Biochemistry, Cell Biology, Biophysics and Bioinformatics 9-12 September 2014, Warsaw, Poland. Acta Biochimica Polonica, 61, supplement 1, Abstracts pp. 84

  6. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2014, Studies of Mutation Accumulation in Three Codon Positions using Monte Carlo Simulations and Metropolis-Hastings Algorithm. BIOSTEC 2014, 7th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2014, 5th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 3-6 March 2014, Angers, Loire Valley, France. Final Program and Book of Abstracts, pp.86, Proceedings, Papers pp. 245-252

  7. Kolenda R., Burdukiewicz M., Rödiger S., Schierack P. 2014, Prevalence of F5 fimbriae in Escherichia coli isolated from diarrheic and healthy calves since 1976 – a meta-analytical approach The 4. Joint Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM) and the Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) 5-8 October 2014, Dresden, Germany.

  8. Mackiewicz P., Wiszniowska T., Stefaniak K., Socha P., Nadachowski A. 2014, Wnioskowanie o diecie niedźwiedzia jaskiniowego w oparciu o analizę grubości i struktury szkliwa zębów. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 89-90

  9. Mackiewicz P. 2014, Mono- czy poligeneza? Pramatka i praojciec. Jaki początek? Wiara i rozum o początku człowieka. Inicjatywa Akademicka Fides et ratio, Towarzystwo Studiów Interdyscyplinarnych przy Papieskim Wydziale Teologicznym we Wrocławiu 26 marzec.2014, Wrocław, Polska.

  10. Mackiewicz P., Baca M., Popović D., Stankovic A., Stefaniak K., Socha P., Marciszak A., Węgleński P., Nadachowski A. 2014, Znaczenie analiz kopalnego DNA. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 91-92

  11. Mackiewicz P. 2014, Software used in phylogenetic analyses Bioinformatyka – rozwój oferty edukacyjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu 24 January 2014, Wrocław, Poland.

  12. Popović D., Baca M., Stefaniak K., Lipecki G., Nadachowski A., Sabol M., Ridush B., Roblíčková M., Káňa V., Stankovic A., Mackiewicz P. 2014, Badania genetyczne populacji niedźwiedzia jaskiniowego (Ursus spelaeus) z Europy Środkowej i Wschodniej. 48. Sympozjum Speleologiczne 16-19 październik 2014, Kletno, Polska. Materiały pp. 105-106

  13. Rödiger S., Burdukiewicz M., Spiess A., Blagodatskikh K., Schierack P. 2014, Statistical methods of comparing digital PCR experiments qPCR & Digital PCR Congress 20-21 October 2014, London, United Kingdom.

2013


  1. Augustyniak D., Bonarowska J., Mackiewicz P., Drulis-Kawa Z. 2013, Antibodies against outer membrane proteins of Moraxella catarrhalis and nontypeable Haemophilus influenza cross-react with various pathogens of human respiratory tract. 15th International Congress of Immunology (ICI) 22-27 August 2013 , Milan, Italy. Front. Immunol. Conference Abstract: doi: 10.3389/conf.fimmu.2013.02.00907

  2. Bielecki M., Mackiewicz P., Śmiga M., Olczak M., Gmiterek A., Olczak T. 2013, Characterization of Porphyromonas gingivalis hmuy homologs from Prevotella intermedia. 5th Congress of European Microbiologists, FEMS 2013 21-25 July 2013, Leipzig, Germany.

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Grabińska M. 2013, On the optimal process of nucleotide substitution. German-Polish Joint Conference on Probability and Mathematical Statistics 6-9 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts and Complete Programme pp. 100-101

  4. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Wańczyk M. 2013, Using Evolutionary Algorithms in Finding of Optimized Nucleotide Substitution Matrices. The Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'13 6–10 July 2013, Amsterdam, The Netherlands. Conference Program pp. 138; Proceedings, Companion ACM: pp. 41-42

  5. Błażej P., Mackiewicz P., Wańczyk M., Cebrat S. 2013, Evolution of Bacterial Genome under Changing Mutational Pressure Computer Simulation Studies. BIOSTEC 2013, 6th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2013, 4th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 11-14 February 2013, Barcelona, Spain. Final Program and Book of Abstracts pp. 33, Proceedings, Papers pp. 272-277

  6. Błażej P., Mackiewicz P., Grabińska M., Cebrat S. 2013, Computer simulation of prokaryotic genomes evolution under two mutational pressures. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 55

  7. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S., Grabińska M. 2013, Is the process of mutation introduction optimized in biological systems? 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 11

  8. Burdukiewicz M., Spiess A., Schierack P., Rödiger S. 2013, dpcR: an R package for the analysis of digital PCR qPCR & Digital PCR Congress 9-10 September 2013, Lyon, France.

  9. Cebrat S. 2013, Sympatric speciation and chromosome evolution in the computer simulations. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 4

  10. Cebrat S. 2013, Genetyczne konsekwencje zapłodnienia pozaustrojowego Poznaj prawdę o in vitro 23 March 2013, Legnica, Polska.

  11. Cebrat S. 2013, Szanse i zagrożenia leczenia niepłodności okiem genetyka NaProTECHNOLOGY W DIAGNOZOWANIU I LECZENIU NIEPŁODNOŚCI. Szanse, wyzwania efekty. 9 March 2013, Góra św. Anny, Polska.

  12. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2013, Model for protein import into the photosynthetic organelles of Paulinella chromatophora inferred from bioinformatics analyses. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 64

  13. Gagat P., Bodył A., Mackiewicz P. 2013, The role of vesicular trafficking in evolution of primary plastids inferred from bioinformatics analyses 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 24

  14. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2013, Comparison of bacterial genome evolution under real and artificial mutational pressures. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 68

  15. Grabińska M., Błażej P., Mackiewicz P. 2013, Evolution of protein coding sequences in two bacterial genomes under mutational pressure associated with replication. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 30

  16. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2013, The role of purifying selection in hotspot distributions along human chromosomes. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 91

  17. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2013, Structural and comparative analysis of the peculiar plastid genome from peridinin dinoflagellate algae. The 13th Annual International Conference Bioinformatics 2013 of the Society for Bioinformatics in Northern Europe and Polish Bioinformatics Society, SocBiN/BIT13 26-29 June 2013, Toruń, Poland. Book of Abstracts pp. 90

  18. Posacki P., Cebrat S. 2013, Simulations of evolution of populations with changing mutation rate. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 57

  19. Rödiger S., Lehmann W., Frömmel U., Böhm A., Nitschke J., Burdukiewicz M., Schröder C., Dangla R., Droniou M., Schierack P. 2013, The Modi Operandi of the VideoScan Platform for the Detection and Analysis of Nucleic Acids Life Science Day 2013, 17. Leibniz Conference of Advanced Science 24 October 2013, Berlin, Germany. Abstract Book pp. 21

  20. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2013, Application of self-organizing maps and evolutionary algorithm in studies of amino acid composition of proteins in microorganisms grouped according to different environmental features. 11th Workshop on Bioinformatics and 6th Symposium of the Polish Bioinformatics 27–29 September 2013, Wrocław, Poland. Abstract Book pp. 58

  21. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2013, Analysis of Relationship Between Amino Acid Composition of Proteins and Environmental Features of Microorganisms Using Evolutionary Algorithm and Self-Organizing Maps. The Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'13 6–10 July 2013, Amsterdam, The Netherlands. Conference Program pp. 138; Proceedings, Companion ACM: pp. 45-46

  22. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Vasquez K. M., Korycka-Machala M., Jaworski A., Dziadek J. 2013, Naprawa podwójnych pęknięć DNA a niestabilności generowane obecnością prostych i odwróconych powtórzeń u Mycobacterium. IV Polski Kongres Genetyki 10-13 września 2013, Poznań, Polska.

2012


  1. Baca M., Stankovic A., Popović D., Stefaniak K., Marciszak A., Hofreiter M., Nadachowski A., Węgleński P., Mackiewicz P. 2012, Genetic and biometric analysis of cave bear specimens from Niedźwiedzia Cave (Sudetes, Poland). The 18th International Cave Bear Symposium (ICBS) and the International Workshop “Fossil remains in karst and their role in reconstructing Quaternary paleoclimate and paleoenvironment” 20-22 September 2012, Băile Herculane, Romania. Program, abstracts, field trip guide Constantin Silviu (ed.), Băile Herculane-Romania: "Emil Racovita" Institute of Speleology, 2012 pp. 15

  2. Błażej P., Mackiewicz P., Wańczyk M. 2012, Sztuczna presja mutacyjna XXXVIII Konferencja Statystka Matematyczna 3-7.12.2012, Wisła, Polska. Streszczenia referatów pp. 12

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2012, Simulation of bacterial genome evolution under replicational mutational pressures. BIOSTEC 2012, 5th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2012, International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 1-4 February 2012, Algarve, Portugal. Final Program and Book of Abstracts pp. 93-94; Proceedings, Papers pp. 51-57

  4. Bonarowska J., Mackiewicz P., Augustyniak D. 2012, Analiza in silico podobieństwa między białkami błony zewnętrznej Moraxella catarrhalis a białkami powierzchniowymi innych patogenów układu oddechowego człowieka II Ogólnopolska Konferencja Naukowo-Szkoleniowa "Wektory i patogeny w przeszłości i przyszłości" 23 listopad 2012, Wrocław, Polska.

  5. Cebrat S. 2012, Prediction of functional structure of eukaryotic chromosomes in computer modeling Polish-German Biochemical Societies Joint Meeting 11-14 September 2012, Poznań, Polska. Acta Biochimica Polonica pp. 19

  6. Cebrat S. 2012, Genetyka - nauka, stawiająca człowieka przed problemami, przed jakimi nigdy w swojej historii nie stawał. Jubileuszowe X Forum Nauczycieli Przedmiotów Przyrodniczych „Od pytania do działania, czyli jak wspólnie z uczniem odkrywać tajemnice przyrody”. 24 listopada 2012, Kraków, Polska.

  7. Cebrat S. 2012, Jak zmienia się genom rodziców i jakie niesie to konsekwencje dla kolejnych pokoleń. Konferencja NaProTECHNOLOGYTM W DIAGNOZOWANIU I LECZENIU NIEPŁODNOŚCI. Szanse, wyzwania efekty. 24 marca 2012, Wrocław, Polska.

  8. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, Protein import into Paulinella photosynthetic organelles. Conference of the Czech Phycological Society 10-13 September 2012, Ostrava, Czech Republic.

  9. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, Protein import into the cyanobacterial endosymbionts/plastids of Paulinella chromatophora. 7th International Symbiosis Society Congress “The earth’s vast symbiosphere” 22-28 July 2012, Kraków, Poland. Book of Abstracts pp. 44

  10. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2012, How protein targeting to primary plastids via the endomembrane system could have evolved? Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 395

  11. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2012, Horizontal gene transfer from bacteroidetes bacteria to dinoflagellate minicircles. 7th International Symbiosis Society Congress “The earth’s vast symbiosphere” 22-28 July 2012, Kraków, Poland. Book of Abstracts pp. 125

  12. Mackiewicz P., Baca M., Stankovic A., Stefaniak K., Marciszak A., Hofreiter M., Nadachowski A., Węgleński P. 2012, Phylogenetic analysis of cave bear specimens from Niedzwiedzia Cave, Sudetes, Poland. Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 278

  13. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2012, Analyses and computer simulations of hotspot distributions in human genome. Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE 2012 23-26 June 2012, Dublin, Ireland. Conference abstracts pp. 831

  14. Proćków M., Pieńkowska J., Mackiewicz P. 2012, Analiza morfologiczna i filogenetyczna Trochulus phorochaetius (Bourguignat, 1864) i pokrewnych taksonów. XXVIII Krajowe Seminarium Malakologiczne 8-11 maja 2012, Boszkowo k/Leszna, Polska. Problemy współczesnej malakologii 2012 pp. 39-40

  15. Waga W., Cebrat S. 2012, Monte-Carlo model of the human genome evolution COST Action MP0801: Physics of Competition and Conflict Annual Meeting 2012 11-13 July 2012, Galway, Ireland.

  16. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2012, Influence of mutational pressure on protein coding sequences in bacterial genomes. Eighteenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 23-27 September 2012, Krynica Morska, Polska. Proceedings of the Eighteenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine pp. 136-141

  17. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2012, Comparison of two algorithms based on Markov processes for recognizing protein coding sequences in prokaryotic genomes. 10th Workshop on Bioinformatics and 5th Symposium of the Polish Bioinformatics Society 25 – 27 May 2012, Gdańsk, Poland. Book of Abstracts pp. 86

  18. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2012, How to deal with small Open Reading Frames? BIOSTEC 2012, 5th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bioinformatics 2012, International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 1-4 February 2012, Algarve, Portugal. Final Program and Book of Abstracts pp. 94-95; Proceedings, Papers pp. 246-250

2011


  1. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Modeling of prokaryotic genome evolution using coding signal as selection pressure The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 103

  2. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Simulation of prokaryotic gene evolution under coding signal as selection pressure. European Conference on Complex Systems, ECCS'11 Vienna 12-16 September 2011, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 20

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2011, Algorithm for finding coding signal using homogeneous Markov chains independently for three codon positions 2011 International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICBCB 2011) 22-24 February 2011, Haikou, China. Proceedings pp. 20-24
    [Download]

  4. Cebrat S. 2011, Genetyczny początek i genetyczny porządek życia ludzkiego Profilaktyka zdrowia prokreacyjnego - Wokół początków ludzkiego życia 15.10.2011, Warszawa, Polska.

  5. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2011, Evolution of the endomembrane system-mediated protein targeting to the plastids with two envelope membranes Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Understanding the Complexity of Diversity 15-20 October 2011, San Feliu de Guixols, Spain.

  6. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2011, Evolution of protein targeting via endomembrane system to primary plastids The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 326

  7. Mackiewicz P., Bodył A., Gagat P. 2011, How nuclear-encoded proteins are imported into the cyanobacterial endosymbionts/plastids of Paulinella chromatophora? Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Understanding the Complexity of Diversity 15-20 October 2011, San Feliu de Guixols, Spain. EMBO Conference Series pp. 120

  8. Mackiewicz P., Drulis-Kawa Z., Maciaszczyk-Dziubińska E., Kropinski A. M. 2011, Clustering and genomic analysis of phages from Podoviridae family The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 608

  9. Mackiewicz D., de Oliveira P. M., de Oliveira S. M., Cebrat S. 2011, Distribution of recombination hotspots in human genome - the comparison of computer simulations and real data The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska. Book of Abstracts pp. 606-607

  10. Sergiel A., Maślak R., Sobczyński M. 2011, Stereotypic behaviour patterns and other stress indicators in captive bears. The 20th International Conference on Bear Research & Management 17-23 July, Ottawa, Canada. Proceedings of the 20th International Conference on Bear Research & Management pp. 187

  11. Sobczyński M., Mackiewicz P. 2011, Application of self-organizing maps to description of relationship between amino acid composition of proteins and ecological properties of microorganisms. The Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 1-6 September 2011, Zakopane-Kościelisko, Poland. Proceedings of the Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. pp. 96-101

  12. Waga W., Cebrat S. 2011, Modelling the Evolution of Spatial Distributed Populations in a Uniformly Changing Environment - Sympatric Speciation. European Conference on Complex Systems, ECCS'11 Vienna 12-16 September 2011, Vienna, Austria. Book of Abstracts pp. 133

  13. Waga W., Cebrat S. 2011, Sympatric speciation in the changing environment - Monte Carlo simulations The 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology June 28 - July 2, 2011, Kraków, Polska.

  14. Wańczyk M., Błażej P., Mackiewicz P. 2011, Comparison of two algorithms based on Markov chains applied in recognition of protein coding sequences in prokaryotes. The Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. 1-6 September 2011, Zakopane-Kościelisko, Poland. Proceedings of the Seventeenth National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine. pp. 118-123

2010


  1. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2010, Nowe podejście do identyfikowania sekwencji kodujących białko w genomach prokariotycznych wykorzystujące modele Markowa III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 233

  2. Błażej P. 2010, Robust estimation of the scale parameter and weighted distributions. International Conference on Robust Statistic 28 June - 2 July 2010, Prague, Czech Republic. Book of Abstracts pp. 14

  3. Błażej P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2010, Using the genetic code wisdom for recognizing protein coding sequences. The 2010 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology, BIOCOMP 2010 12-15 July 2010, Las Vegas Nevada, USA. Proceedings of the 2010 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology, Vol. I pp. 302-305
    [Download]

  4. Bodył A., Mackiewicz P., Gagat P. 2010, Did trypanosomatid parasites contain a plastid in their evolutionary past? 14th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 21-24 September 2010, Marseilles, France. Book of Abstracts: Poster 30

  5. Cebrat S., Waga W., Biecek P. 2010, Modelling evolution of Y chromosome, altruism and sexual antagonism or from biological to social conflicts Annual Meeting of COST Action MP0801:Physics of Competitions and Conflicts 27 May, Sofia Sunny Beach, Bulgaria.

  6. Cebrat S. 2010, Co to znaczy "losowy" w teorii ewolucji? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 204

  7. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2010, How endomembrane-system mediated protein targeting into primary plastids could have evolved? 14th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 21-24 September 2010, Marseilles, France. Book of Abstracts: PP9

  8. Gagat P., Mackiewicz P., Bodył A. 2010, W jaki sposób wyewoluował wewnątrzbłonowy szlak importu białek do plastydów pierwotnych? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 208

  9. Kowalski J., Cebrat S. 2010, Evolution of the recombination rate distribution along chromosome in Penna model. XVI Krajowa Konferencja Zastosowań Matematyki w Biologii i Medycynie 14-18 września 2010, Krynica, Polska. Proceedings of the Sixteen National Conference on Applications of Mathematics in Bology and Medicine pp. 71-75

  10. Mackiewicz D., Waga W., Zawierta M., Cebrat S. 2010, Strategies of eukaryotic chromosome evolution - comparing the real human and virtual, computer simulated genomes. The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 33

  11. Mackiewicz P., Wyroba E. 2010, Duplication events in evolution of Rab7 and Rab9 proteins. The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 32
    [Download]

  12. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2010, Pochodzenie bakteryjne niektórych minichromosomów u bruzdnic Ceratium horridum i Pyrocystis lunula III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 209

  13. Mackiewicz P., Bodył A. 2010, W jaki sposób białka kodowane przez jądro gospodarza są transportowane do endosymbiontów cyjanobakteryjnych u Paulinella chromatophora? III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 259

  14. Mackiewicz D., Waga W., Zawierta M., Cebrat S. 2010, Rekombinacja a ewolucja chromosomów eukariotycznych III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 57

  15. Sergiel A., Sobczyński M. 2010, Monitoring stress in captive bears using non-invasive fecal enzyme immuno-assay (EIA) The 19th International Conference on Bear Research and Management 16-22 May 2010, Tbilisi, Georgia.

  16. Sergiel A., Sobczyński M. 2010, Monitoring stress in captive bears using non-invasive fecal enzyme immuno-assay (EIA). Sesja naukowa Polskiego Towarzystwa Etologicznego 16 października, Warszawa, Polska. The book of abstracts pp. 22

  17. Sochocka M., Zaczyńska E., Sobczyński M., Czarny A., Taboł A., Leszek J., Błach-Olszewska Z. 2010, Influence of donepezil and Ginkgo Biloba extract (EGB 761) on innate antiviral immunity of human leukocytes The 4th European Congress of Virology 7-11 April 2010, Cernobbio, Lake Como, Italy.

  18. Strzała T., Kosowska B., Mackiewicz P., Pilot M., Moska M., Marszałek-Kruk B., Stamatis C., Mamuris Z. 2010, Charakterystyka genetyczna polskiej populacji zająca szaraka Lepus europaeus na podstawie mitochondrialnego DNA III Polski Kongres Genetyki 12-15 wrzesień 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 168

  19. Waga W., Mackiewicz D., Cebrat S. 2010, Genome evolution in the computer models of sympatric speciation in the spatially distributed populations The 18th Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2010 4-8 July 2010, Lyon, France. Conference program pp. 35
    [Download]

  20. Waga W., Cebrat S. 2010, Computer modelling of biological conflicts in the human reproduction Annual Meeting of COST Action MP0801:Physics of Competitions and Conflicts 27 May, Sofia, Sunny Beach, Bulgaria.

  21. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2010, Unusual DNA structures and instabilities in mycobacterial genome Warsztaty Mikrobiot 2010, II Ogólnopolskie Warsztaty Mikrobiologia w Ochronie Zdrowia i Srodowiska 9-10 wrzesień 2010, Łódz, Polska.

  22. Wójcik E. A., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2010, Niezwykłe struktury DNA a niestabilność genomu mykobakterii III Polski Kongres Genetyki 12-15 września 2010, Lublin, Polska. Streszczenia pp. 240

  23. Zwolińska K., Piasecki E., Sobczyński M., Knysz B., Gąsiorowski J., Gładysz A. 2010, KIR3DL1/L1 and KIR3DL1/S1 genotypes against HIV-1 infection. The 4th European Congress of Virology 7-11 April 2010, Cernobbio, Lake Como, Italy.

2009


  1. Błażej P. 2009, Robust estimation of the scale parameter in weighted models. The Pyrenees International Workshop on Statistics Probability and Operations Research. 15-18 September 2009, Jaca, Spain. Book of Abstracts pp. 37

  2. Bodył A., Mackiewicz P., Stiller J. W., Gagat P. 2009, How are nuclear-encoded proteins imported into the cyanobacterial endosymbionts of Paulinella chromatophora Leopoldina-Symposium, Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria 20-23 September 2009, Berlin, Germany. Book of Abstracts pp. 48

  3. Bodył A., Mackiewicz P., Gagat P. 2009, Pre-sequences of class c iron-containing superoxide dismutases provide evidence for the former existence of a plastid in trypanosomatid parasites Leopoldina-Symposium, Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria 20-23 September 2009, Berlin, Germany. Book of Abstracts pp. 47

  4. Bodył A., Mackiewicz P. 2009, Do cyanobacterial endosymbionts of the amoeba Paulinella chromatophora possess an import apparatus for nuclear-encoded proteins? A hypothesis based on analysis of their complete genome and other cyanobacterial genomes Workshop on Molecular Systematics of Amoebozoa and Rhizaria 12-13 January 2009, Geneva, Switzerland.

  5. Cebrat S. 2009, Problemy neo-darwinizmu 150 lat po Darwinie. Od syntezy chemicznej do biologii syntetycznej. Konferencja dedykowana profesorowi Andrzejowi Legockiemu z okazji 70 rocznicy urodzin. 19-20 pazdziernika 2009, Poznań, Polska.

  6. Cebrat S. 2009, Początek życia człowieka - miłość czy in vitro? XXXIX Wrocławskie Dni Duszpasterskie "Misterium Miłości" 27-29 sierpnia 2009 , Wrocław, Polska.

  7. Cebrat S. 2009, Biologiczne argumenty przeciwko zapłodnieniu in vitro (u człowieka). Sympozjum Naukowe Papieskiego Wydziału Teologicznego, Swiętość ludzkiego życia. Wokół Instrukcji 3 marzec 2009, Wrocław, Polska.

  8. Chrobak A., Szopa A., Rossowska J., Sobczyński M., Gabryś M. 2009, Flow cytometry as a potential instrument for non-invasive simple method of mild endometriosis diagnosis The 14th Leipziger Workshop: Cytomics and Regenerative Medicine and 7th International Workshop: Slide-Based Cytometry 2–4 April, Leipzig, Germany. Abstracts of the 14th Leipziger Workshop: Cytomics and Regenerative Medicine and 7th International Workshop: Slide-Based Cytometry, Cytometry Part A, Volume 75A (8) pp. 713

  9. Mackiewicz P., Wiszniowska T., Stefaniak K., Socha P., Olejniczak A. J., Nadachowski A. 2009, Analysis of dental enamel thickness in fossil bears Ursus spelaeus and U. wenzensis in comparison to selected representatives of mammals Paleontological Conference. Fossil Vertebrates – Morphology, Systematics, Evolution 3-5 December 2009, Wrocław, Polska. Abstracts pp. 37-38

  10. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2009, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Machines on genes: enzymes that make, break, and move DNA and RNA. Biochemical Society Meeting 12 - 14 August 2009, Robinson College, Cambridge, United Kingdom.

  11. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2009, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Konferencja: „Wyzwania współczesnej biologii komórki – genetyka molekularna, biologia systemów, bioinformatyka” (The Challenges of Contemporary Cell Biology – Molecular Genetics, System Biology, Bioinformatics) 20-21 April 2009, Łódz, Polska.

  12. Sochocka M., Zaczyńska E., Taboł A., Sobczyński M., Leszek J., Błach-Olszewska Z. 2009, Comparison of donapezil and Ginkgo biloba (EGb 761) effect on innate antiviral immunity of human leukocytes. VI Kongres Polskiego Towarzystwa Psychogeriatrycznego (PTPG) 3-4 grudnia 2009, Wrocław, Polska.

  13. Strzelecki J., Sobczyński M., Hryniewicz W., Sadowy E. 2009, Polymorphism of three selected virulence genes in Enterococcus faecalis. European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 16-19 May 2009, Helsinki, Finland.

  14. Waga W. 2009, Sympatric speciation in populations distributed in uniformly changing environment. Physics and Competition of Conflicts, 1st annual meeting 28-30 May 2009, Rome, Italy. Abstracts pp. 54

  15. Wiszniowska T., Mackiewicz P., Socha P., Stefaniak K., Nowakowski D., Nadachowski A. 2009, Dental enamel structure in fossil bears Ursus spelaeus and U. wenzensis in comparison to different representatives of other Carnivora Paleontological Conference. Fossil Vertebrates – Morphology, Systematics, Evolution 3-5 December 2009, Wrocław, Polska. Abstracts pp. 67-68

2008


  1. Biecek P. 2008, Analiza sekwencji DNA w pobliżu miejsca terminacji translacji w różnych prokaryotach. Matematyczne metody biologii, seminarium UW 23 04 2008, Warszawa, Polska.

  2. Biecek P. 2008, Testing procedures for Hierarchically Related Hypotheses and some examples in functional genomics The 3rd Warsaw-Berlin Workshop on Computational Biology 7 marzec 2008, Berlin, Niemcy.

  3. Biecek P., Zagdanski A., Cebrat S. 2008, Improving the detection performance for gene set functional enrichment and transcription factor binding sites analysis RECOMB 2008 29 03 2008, Singapur, Singapur.

  4. Biecek P., Cebrat S. 2008, Why the Y chromosome shrinks and women live longer than men Systems Biology Seminar 27 07 2008, Aberdeen, Scotland.

  5. Biecek P. 2008, Wybrane zagadnienia związane z testowaniem zbioru hipotez o hierarchicznej strukturze zależności Seminaria statystyka matematyczna i inne zastosowania probabilistyczne. IMPAN 17 styczen 2008, Warszawa, Polska.

  6. Biecek P., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Banaszak J., Cebrat S. 2008, Analysis of translation termination sites in prokaryotes Bioinformatics 2008 24-27 April 2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 7

  7. Biecek P. 2008, Projekt HapMap, prezentacja danych oraz przykładowe wyniki analizy sprzężeń pomiędzy loci Seminaria Biologii Obliczeniowej. Uniwersytet Warszawski 13 styczen 2008, Warszawa, Polska.

  8. Cebrat S. 2008, Czy ewolucja ewoluuje Studium Generale 24.04.2008, Wrocław, Polska.

  9. Cebrat S. 2008, Problemy z zapłodnieniem in vitro UNESCO Chair of Interdysciplinary Studies 08 02 2008, Wrocław, Polska.

  10. Cebrat S., Zawierta M., Waga W., Bońkowska K., Mackiewicz D. 2008, The role of kinship in the fertility and genome and population evolution European Conference Mathematical and Theoretical Biology 29 07 2008, Edinburgh, Scotland.

  11. Cebrat S. 2008, Fecundity, kinship and genome structure Proteomics Meets Medicine 10.10.2008, Wrocław, Poland.

  12. Cebrat S. 2008, Ab-zymy i Lamarck Studium Generale 08.06.2008, Wrocław, Polska.

  13. Cebrat S., Biecek P. 2008, Evolution of sex chromosomes – why Y chromosome shrinks ECCS Jeruzalem 13 - 21 09. , Jerozolima, Izrael.

  14. Cebrat S., Waga W., Zawierta M. 2008, Non-monotonous relation between fecundity and kinship or relation between the crossover rate and inbreeding coefficient The Congress of Biochemistry and Cell Biology 7-11.09., Olsztyn, Polska. Acta Biochimica Polonica, 55(s3) pp. 38

  15. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Phase transition in the biological evolution Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  16. Cebrat S. 2008, Ab-zymy i Lamarck Studium Generale 08.06.2008, Wrocław, Polska.

  17. Cebrat S., Biecek P. 2008, Why Y chromosome is short and women live longer than men Dynamics of Complex Systems 08 03 2008, Warszawa, Polska.

  18. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Modelling the relation between kinship and fertility 12th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 23 - 26 09 2008, Marseille, Francja.

  19. Cebrat S., Biecek P. 2008, Dlaczego chromosom Y jest krótki a kobiety żyją dłużej? Człowiek wobec masowych zjawisk społecznych 19 05 2008, Wrocław, Polska.

  20. Cebrat S., Zawierta M., Waga W. 2008, Modeling the evolution of eukaryotic chromosomes Polish-Russian Biotechnology Symposium 15-17. 10, Moscow, Russia.

  21. Gisterek I., Matkowski R., Sedlaczek P., Szewczyk K., Staszek U., Biecek P., Lacko A., Bebenek M., Pudelko M., Kornafel J. 2008, Vascular Endothelial Growth Factor C serum levels in patients with breast cancer ESTRO27 14 September 2008, Goteborg, Sweden. Radiotherapy and Oncology, Journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology Volume 88 Supplement 2
    [Download]

  22. Mackiewicz P., Wyroba E. 2008, Evolution of Rab7 and Rab9 proteins. Bioinformatics 2008 Conference 24-27 April 2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 49

  23. Mackiewicz P., Biecek P., Mackiewicz D., Kiraga J., Bączkowski K., Sobczyński M., Cebrat S. 2008, Optimisation of Asymmetric Mutational Pressure and Selection Pressure Around the Universal Genetic Code. Computational Science – ICCS 2008, 8th International Conference 23-25.06.2008, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science, 5103 pp. 100-109
    [Download]

  24. Pitts N., Longbottom C., Hall A., Czajczynska-Waszkiewicz A., Łoś P., Masalski M., Biecek P., Christie A. 2008, Diagnostic Accuracy of an Optimised AC Impedance Device to Aid Caries Detection and Monitoring 55th ORCA 2008, Groningen, The Netherlands. Caries Res 2008;42:185-238 Vol 42. No 3 pp. 185-238
    [Download]

  25. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Międzynarodowa Konferencja Komitetu Mikrobiologii PAN, Wydziału II Nauk Biologicznych PAN i Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego. Vaccines: plant biotechnology, cancer and infectious diseases therapy 28-29 November 2008, Warszawa, Polska.

  26. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Niezwykłe struktury DNA. Wewnętrzny mutagen czy zródło zmienności genomu mykobakterii? Replikacja i segregacja bakteryjnego materiału genetycznego , Szczepanów, Polska.

  27. Rychta E., Brzostek A., Bacolla A., Mackiewicz P., Dziadek J. 2008, Unusual DNA structures as endogenous mutagen or the source of genetic instability in mycobacterial genome Warsztaty Mikrobiot 2008, I Ogólnopolskie Warsztaty Mikrobiologia w Ochronie Zdrowia i Srodowiska 25-26 wrzesień 2008, Łódz, Polska.

  28. Rymaszewska J., Wojtynska R., Biecek P., Kustrzycki W., Dzielak K. 2008, Depression and anxiety of CABG patients - long-term follow-up European Psychiatry Volume 23, numero S2 April 2008, , France. Doi : 10.1016/j.eurpsy.2008.01.230 pp. 63
    [Download]

  29. Sieradzki A., Okolow T., Adamowski T., Kiejna A., Trafidlo E., Weyde W., Biecek P., Morawska N. 2008, Sleep disorders in patients with end-stage renal disease. European Psychiatry Volume 23, numero S2 April 2008, , France. Doi : 10.1016/j.eurpsy.2008.01.591 pp. 280-281
    [Download]

  30. Sobczyński M., Mackiewicz P., Lipiński P., Cebrat S. 2008, The application of Self Organizing Maps and evolutionary algorithms to distinguish bacterial proteomes. 7th World Congress in Probability and Statistics 14 – 19, July, 2008, , Singapore. Program, Abstracts and Directory of Participants pp. 188-189

  31. Sobczyński M., Mackiewicz P., Cebrat S. 2008, Relationship between amino acid composition and ecological properties of Prokaryotes. Bioinformatics 2008 Conference 24-27.04.2008, Warszawa, Polska. Book of Abstracts pp. 77

  32. Waga W., Zawierta M. 2008, Sympatric speciation in populations with high inbreeding coefficient Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  33. Zawierta M., Waga W. 2008, Sympatric speciation in panmictic populations Evolution and Physics, Concepts, Models and Applications 20 - 23. 01. 2008, Bad Honnef, Niemcy.

  34. Zynek-Litwin M., Kuzniar J., Marchewka Z., Kopec W., Kusztal L., Patrzalek D., Biecek P., Dlugosz A., Klinger M. 2008, Transplantation. 86(2S) Supplement:308 Transplantation 27 July 2008, Sydney, Australia. Transplantation
    [Download]

  35. Zynek-Litwin M., Kuzniar J., Marchewka Z., Kopec W., Kusztal L., Szymanska B., Patrzalek D., Biecek P., Klinger M. 2008, Neutrophils degranulation marker - leucocyte elastase-A1protease inhibitor complex: a comparative study with classic (A1M, B2M) and novel (NGAL, IL-18) kidney graft injury markers. Transplantation. 86(2S) Supplement:359 27 July 2008, Sydney, Australia. Transplantation
    [Download]

2007


  1. Bączkowski K., Nevozhay D.Dmitry , Kiraga J., Biecek P., Mackiewicz P., Cebrat S. 2007, Generowanie długich ramek odczytu przez geny w genomach prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 282-283

  2. Biecek P., Susłowicz K., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kiraga J., Cebrat S. 2007, Analiza składu nukleotydowego i kodonowego w okolicach sygnału stop translacji w genomach prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 289-290

  3. Biecek P. 2007, Detekcje wielowymiarowych interakcji wykorzystując metody analizy skupień II Polski Kongres Genetyki 17 wrzesien 2007, Warszawa, Polska.

  4. Biecek P. 2007, Zastosowania statystyki i informatyki w genomice i badaniach dynamiki populacji. Seminaria Matematyczne metody biologii. Uniwersytet Warszawski 12 grudzien 2007, Warszawa, Polska.

  5. Bońkowska K., Kula M., Biecek P., Cebrat S. 2007, Pandemics and immune memory in the noisy Penna model. SPIE Conference, Noise and Fluctuations in Biological, Biophysical and Biomedical Systems 20-24 May 2007, Florence, Italy.

  6. Bońkowska K., Cebrat S. 2007, Modeling the age structured population without the logistic equation of Verhulst. How to bridge theoretical predictions to empirical data. , Torino, Italy.

  7. Cebrat S. 2007, Genome evolution during speciation. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  8. Cebrat S. 2007, Sympatric speciation and population expansion. COST ’07 , Palermo, Italy.

  9. Cebrat S. 2007, Optimisation of asymmetric mutational pressure and selection pressure around the universal genetic code. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  10. Cebrat S., Biecek P., Bońkowska K. 2007, White noise and synchronization shaping the age structure of the human population. SPIE Conference, Noise and Fluctuations in Biological, Biophysical and Biomedical Systems 20-24 May 2007, Florence, Italy.

  11. Cebrat S. 2007, Symulacje komputerowe ewolucji genom??w. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska.

  12. Cebrat S., Waga W., Zawierta M., Mackiewicz D. 2007, Interplay between Inbreeding and Intragenomic Recombination Responsible for Sympatric Speciation. Genetic and Biological Networks, ECCS ‘07 , Dresden, Germany.

  13. Cebrat S. 2007, Modeling the evolution of age structured populations and ageing processes. From Genetics to Mathematics, MCRTN Marie Curie Research Training Network , Zbąszyń, Polska.

  14. Cebrat S. 2007, Strategy of genome evolution in the expanding populations. Evolutionary Computation and Global Optimization 2007 Conference 11-14 June 2007, Będlewo, Polska.

  15. Cebrat S. 2007, Phenomena associated with sympatric speciation in the expanding populations. Max Born 23 , Polanica-Zdrój, Polska.

  16. Kiewra D., Sobczyński M. 2007, Ryzyko zakażenia krętkami Borrelia burgdorferi na terenia Wrocławia i Slężańskiego Parku Krajobrazowego. IX Miedzynarodowe Sympozjum Stawonogi Pasożytnicze, Alergogenne i Jadowite Znaczenie Medyczne i Sanitarne 15-18 May 2007, Kazimierz Dolny, Polska.

  17. Łoś P., Pitts N., Longbottom C., Hall A., Czajczynska-Waszkiewicz A., Masalski M., Biecek P., Kochan S. 2007, Ac-Impedance Spectroscopy technique for the detection of dental caries in human teeth 54th Annual ORCA Congress 2007, Helsingor , Denmark. Caries Res. 2007 Vol.41 nr 4; s.296-297 poz.80, Abstracts of the 54th Annual ORCA Congress pp. 296-297

  18. Mackiewicz D., Waga W., Cebrat S. 2007, Computer modeling of genome evolution during sympatric speciation. COST "Global versus local dynamics on networks", ECCS ’07 , Dresden, Germany.

  19. Mackiewicz P., Wyroba E. 2007, Analiza filogenetyczna i taksonomiczna białek Rab7 i Rab9. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 228

  20. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2007, Analiza strukturalna i ewolucja osobliwego genomu plastydowego bruzdnicy Adenoides eludens (Dinoflagellata). II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 82-83

  21. Mackiewicz P., Moszczyński K., Bodył A. 2007, Phylogenetic and structural analysis of the pecuilar plastid genome of Adenoides eludens (Dinoflagellata). The 10th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis 10-13 September 2007, Gmunden, Austria. Book of Abstracts pp. 42

  22. Mackiewicz D., Kiraga J., Mackiewicz P., Biecek P., Bączkowski K., Cebrat S. 2007, Zależność między punktem izoelektrycznym białek proteomów bakterii a warunkami ich życia. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 104-105

  23. Rydzanicz K., Sobczyński M. 2007, Szacowanie wpływu środowiska na efektywność działania mikrobiologicznych larwicydów wobec komarów Culex pipiens molestus. IX Miedzynarodowe Sympozjum Stawonogi Pasożytnicze, Alergogenne i Jadowite Znaczenie Medyczne i Sanitarne 15-18 May 2007, Kazimierz Dolny, Polska.

  24. Sobczyński M., Mackiewicz P., Cebrat S. 2007, Zależności między składem aminokwasowym proteomów prokariotycznych a ich filogenezą i właściwościami ekologicznymi. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 283

  25. Sobczyński M., Mackiewicz P., Lipiński P., Cebrat S. 2007, Zastosowanie sieci Kohonena i algorytmów ewolucyjnych do różnicowania proteomów prokariotycznych. II Polski Kongres Genetyki 18-20 September 2007, Warszawa, Polska. Streszczenia pp. 283-284

  26. Waga W., Mackiewicz D., Zawierta M., Bońkowska K., Cebrat S. 2007, Inbreeding and crossover rate determine space for life. How to bridge theoretical predictions to empirical data , Torino, Italy.

  27. Waga W., Cebrat S. 2007, How the local, limited interactions affect the evolution? Erice ’07 Statistical physics of social dynamics: opinions, semiotic dynamics, language. , Erice, Italy.

  28. Waga W., Mackiewicz D., Zawierta M., Cebrat S. 2007, Modeling the genetic phenomena responsible for sympatric speciation. Statphys 23 , Genua, Italy.

  29. Zaczyńska E., Czarny A., Jankowska E. A., Sobczyński M., Ponikowski P. 2007, NF-kappa-B expression in mononuclear cells from patients with chronic heart failure that observed in endotoxin tolerance. IV Konferencja Naukowo- Szkoleniowa Immunomodulacja: badania doświadczalne i kliniczne. 25-26 May 2007, Jurata, Polska.

2006


  1. Banaszak J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Sobczyński M., Cebrat S. 2006, The isoelectric point of proteomes and the ecology of organisms. The 2nd FEMS Congress of European Microbiologists 4-8 July 2006, Madrid, Spain. Scientific Programme, P.GAP.3 pp. 69

  2. Bodył A., Mackiewicz P. 2006, Analysis of the targeting sequences of an iron-containing superoxide dismutase (SOD) gene of the dinoflagellate Lingulodinium polyedrum suggests function in multiple cellular compartments. The 16th Meeting of the International Society for Evolutionary Protistology 1-5 August 2006, Wrocław, Polska. Abstract Book pp. 32

  3. Bońkowska K., Biecek P., Cebrat S. 2006, Why does the age structure of human population change? Annual Meeting COST Action P10. Physics of Risk 13-16 May 2006, Vilnius, Lithuania.

  4. Cebrat S. 2006, Chaos, genetic defects and population evolution. Winter School: Application of genomics and bioinformatics in animal biotechnology. 1-3 February 2006, Jastrzębiec, Polska.

  5. Cebrat S., Zawierta M., Wolfigiel M., Biecek P. 2006, Monte Carlo Simulation of Evolvability The 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles 20-22 September 2006, Marseilles, France.

  6. Cebrat S. 2006, Modelowanie procesów starzenia i dynamiki populacji metodą Monte Carlo. Seminaria Biologii Obliczeniowej. Uniwersytet Warszawski 12 June 2006, Warszawa, Polska.

  7. Cebrat S. 2006, Nielosowe procesy mutacji i rekombinacji w procesie ewolucji. KSI UNESCO 27 October 2006, Wrocław, Polska.

  8. Cebrat S. 2006, Ageing and population evolution. Trinity College Seminars 10 February 2006, Dublin, Ireland.

  9. Cebrat S., Biecek P. 2006, Relations between organisms and environment in the ageing process. 2nd International Conference Management of Risk Factors 2 (MARF2) 31 August - 3 September 2006, Rome, Italy.

  10. Cebrat S., Zawierta M., Wolfigiel M., Biecek P. 2006, Evolution of relation between mutation and recombinantion rates. Oxford, ECSS and GIACS CRP Forum Conferences 25–30 September 2006, Oxford, United Kingdom.

  11. Polak N., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2006, Relations between genes´ length and the rate of their divergence. The 2nd FEMS Congress of European Microbiologists 4-8 July 2006, Madrid, Spain. Scientific Programme, P.GAP.35 pp. 71

  12. Smolarczyk K. 2006, Symulacja Monte Carlo ewolucji genów i genomów, czyli tempo dywergencji w zależności od częstości mutacji i wielkości populacji. Warsztaty Biologii Ewolucyjnej Komitetu Biologii Ewolucyjnej i Teoretycznej PAN 25 February 2006, Warszawa, Polska.

2005


  1. Banaszak J., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Długość białek a punkt izoelektryczny – analizy proteomów i symulacje komputerowe. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 14

  2. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Isoelectric point of proteins under the mutational pressure. Genes, Genomes and Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  3. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Sobczyński M., Bączkowski K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, How proteins evolve under selection for their isoelectric point - computer simulations. The 10th Congress European Society for Evolutionary Biology. 15-20 August 2005, Kraków, Polska. Abstract Book pp. 299

  4. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, The ecology of bacteria and isoelectric point of their proteomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 7

  5. Banaszak J., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Polak N., Sobczyński M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Dywergencja sekwencji a wartość punktu izoelektrycznego białka. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 13

  6. Bączkowski K., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Banaszak J., Sobczyński M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Optimisation of the Genetic Code. The 10th Congress European Society for Evolutionary Biology. 15-20 August 2005, Kraków, Polska. Abstract Book pp. 298

  7. Cebrat S. 2005, The role of crossing-over in the computer simulated populations. Gliwice Scientific Meetings 18-19 November 2005, Gliwice, Polska.

  8. Cebrat S. 2005, How selection modulates mutational pressure? Application of genomics and bioinformatics in animal biotechnology 30 January 2005, Jastrzębiec, Polska.

  9. Cebrat S. 2005, Simulations of the inside introns recombinations. Genes, Genomes, Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  10. Cebrat S. 2005, Genomic walks Geometry of Genome 22-24 September 2005, Leicester, United Kingdom.

  11. Cebrat S. 2005, Od struktury demograficznej do struktury genomów w modelowaniu komputerowym. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska.

  12. Cebrat S., Masa M., Stauffer D. 2005, Telomeres, life expectancy and RISK of cancer. COST Action Meeting 24 April 2005, Toledo, Spain.

  13. Dudek M. R., Cebrat S., Mackiewicz P., Kowalczuk M. 2005, Segmentation profiles of DNA sequences. Genes, Genomes and Populations Evolution 29 September - 2 October 2005, Wrocław, Polska.

  14. Godowska W., Mackiewicz P., Polak N., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2005, Wnioskowanie o presji mutacyjnej na podstawie używalności kodonów stop translacji w genomach bakteryjnych. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 27

  15. Mackiewicz P., Bodył A. 2005, Analiza bioinformatyczna sekwencji kierujących białka do plastydów trójbłonowych. Konferencja: Genomika i mikromacierze w biologii i medycynie. 25-28 June 2005, Sucha Beskidzka, Polska. Program – Streszczenia - Indeks autorów pp. 15

  16. Mackiewicz D., Nowicka A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Banaszak J., Cebrat S., Dudek M. R. 2005, Relation between amino acid frequencies and their relative substitution rates under mutation pressure and selection pressure. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 25

  17. Mackiewicz P., Bodył A. 2005, Organisation and diversity of the targeting signals of proteins imported into plastids with three envelope membranes. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 26

  18. Mackiewicz P. 2005, Influence of replication of DNA on organization and evolution of bacterial genomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 5-6

  19. Sobczyński M., Bączkowski K., Mackiewicz P., Cebrat S. 2005, Non-random distribution of genes of different length on prokaryotic chromosomes. The International Conference Sequence-Structure-Function Relationships; Theoretical and Experimental Approaches 6-10 April 2005, Warszawa, Polska. Abstracts pp. 37

  20. Sobczyński M., Mackiewicz P., Bączkowski K., Cebrat S. 2005, Genes of different length are non-randomly distributed on prokaryotic chromosomes. The 40th Meeting of the Polish Biochemical Society 19-23 September 2005, Lublin, Polska. Acta Biochimica Polonica 52, Suppl. 1/2005 pp. 25

2004


  1. Banaszak J. 2004, Selection pressure on isoelectric point of proteins. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  2. Banaszak J., Mackiewicz P., Polak N., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Punkt izoelektryczny białek – analizy proteomów i symulacje komputerowe. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 206-207

  3. Bartkowiak A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2004, Probabilistic PCA and neural networks in search of representative features for some yeast genome data. The Symposium On Methods Of Artificial Intelligence AI-Meth 2004 and The Workshop On Knowledge Acquisition In Mechanical Engineering 17-19 November 2004, Gliwice, Polska. Proceedings Of The Symposium On Methods Of Artificial Intelligence AI-Meth 2004 and The Workshop On Knowledge Acquisition In Mechanical Engineering pp. 17-18
    [Download]

  4. Bączkowski K., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Poszukiwanie sekwencji kodujących wsród krótkich ORFów w genomie drożdży Saccharomyces cerevisiae. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 207

  5. Bocer T., Wołoszyńska M., Mackiewicz P., Jańska H. 2004, The fragment of the chloroplast DNA was acquired by bean mitochondrial genome by horizontal DNA transfer. The 29th Meeting of the Federation of the Biochemical Societies 26 June - 1 July 2004, Warszawa, Polska. EJB, The FEBS Journal 271 (suppl. 1) pp. 213

  6. Cebrat S., Pękalski A. 2004, The Role of Dominant Mutations in the Population Expansion. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 765-770

  7. Cebrat S. 2004, Gene evolution under directional, asymmetric mutational pressure. Workshop Application of Genomics and Bioinformatics in Animal Biotechnology 3 February 2004, Sucha Beskidzka, Polska.

  8. Cebrat S., Radomski J. P., Stauffer D. 2004, Genetic Paralog Analysis and Simulations. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 709-717

  9. Cebrat S. 2004, Concert of the mutational and selection pressure on the genetic code. Computational and Mathematical Population Dynamics 7 Destobio 3 21-25 June 2004, Trento, Italy.

  10. Cebrat S. 2004, Introns, gamete preselection and two meiotic divisions in sex reproduction. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  11. Cebrat S. 2004, Monte Carlo simulations of genes, genome and populations evolution. I Conference of COST Action P10 – Physics of Risk. April 2004, Nyborg, Denmark.

  12. Mackiewicz D., Polak N. 2004, Simulation and analyses of the gene sequence divergence. Herbstseminar in Chribska "Bioinformatics and Biochemistry" October 2004, Chribska, Czech Republic.

  13. Mackiewicz P., Zakrzewska-Czerwińska J., Zawilak A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Reguły wyznaczania regionu inicjacji replikacji w genomach bakteryjnych. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 189-190

  14. Mackiewicz P. 2004, Identyfikowanie regionu inicjacji replikacji chromosomów bakterii in silico. Seminarium z cyklu "Obliczeniowa biologia", w ramach Centrum Zastosowań Matematyki, Instytutu Matematycznego PAN 15 November 2004, Warszawa, Polska.

  15. Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Banaszak J., Polak N., Smolarczyk K., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Differential Gene Survival under Asymmetric Directional Mutational Pressure. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 687-693

  16. Polak N., Mackiewicz P., Banaszak J., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Zależność stabilności genów od ich długości. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 205-206

  17. Polak N., Banaszak J., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Smolarczyk K., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, How Gene Survival Depends on Their Length. Computational Science – ICCS 6-9 June 2004, Kraków, Polska. Lecture Notes in Computer Science 3039 pp. 694-699

  18. Smolarczyk K., Mackiewicz P., Polak N., Banaszak J., Dudkiewicz M., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2004, Ewolucja genów w asymetrycznych genomach bakteryjnych. Polski Kongres Genetyki, XV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego, IV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka 6-9 September 2004, Gdańsk, Polska. Streszczenia pp. 206

  19. Wołoszyńska M., Bocer T., Mackiewicz P., Jańska H. 2004, A fragment of chloroplast DNA was transferred horizontally from magnoliids to mitochondrial genome of Phaseolus. Gordon Research Conference Mitochondria & Chloroplasts 25-30 July 2004, Kimball Union Academy Meriden, USA.

2003


  1. Bartkowiak A., Szustalewicz A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2003, Kohonen's self-organizing maps in visualizing of some yeast DNA data. LX Scientific Session of the Polish Biometric Society 5 December 2003, Poznań, Polska. Listy Biometryczne – Biometrical Letters 40(2) pp. 85

  2. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Banaszak J., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Evolution of protein coding sequences under directional mutational pressure. The XVII Max Born Symposium 22-25 September 2003, Lądek-Zdrój, Polska. Book of Abstracts pp. 14

  3. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Properties of Genetic Code under Directional, Asymmetric Mutational Pressure. Computational Science – ICCS 2-4 June 2003, St. Petersburg, Russia. Lecture Notes in Computer Science 2657 pp. 343-350

  4. Kowalczuk M., Dudkiewicz M., Polak N., Dudek M. R., Cebrat S. 2003, Asymmetric mutational pressure associated with replication and strategy of gene evolution. XIX International Congress of Genetics 6-11 July 2003, Melbourne, Australia. Book of Abstracts pp. 138

  5. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Nowicka A., Smolarczyk K., Łaszkiewicz A. 2003, Gene inversions and rate of their divergence. XIX International Congress of Genetics 6-11 July 2003, Melbourne, Australia. Book of Abstracts pp. 24

  6. Nowicka A., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Cebrat S., Dudek M. R. 2003, Correlation between mutation pressure, selection pressure and occurrence of amino acids. Computational Science – ICCS 2-4 June 2003, St. Petersburg, Russia. Lecture Notes in Computer Science 2658 pp. 650-657

2002


  1. Bartkowiak A., Szustalewicz A., Cebrat S., Mackiewicz P. 2002, Visualization of coding and not-coding pieces of DNA using vector quantization and self organizing maps. The XXIth International Biometric Conference 21-26 July 2002, Freiburg, Germany. Proceedings – Abstracts of Special and contributed Paper Presentations pp. 171-172

  2. Cebrat S., Szymczak S., Łaszkiewicz A. 2002, Prediction of the Human Life Expectancy International Workshop on Complex Systems in Natural and Social Sciences 26-29 September 2002, Matrafured, Hungary.

  3. Cebrat S., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M. 2002, Aproksymowanie liczby genów w genomach prokariotycznych. XXXI Ogólnopolska Konferencja Zastosowań Matematyki 17-24 September 2002, Zakopane, Polska.

  4. Cebrat S., Szymczak S., Łaszkiewicz A. 2002, Przewidywanie zmian struktury wiekowej populacji w modelu Penna. XXXI Ogólnopolska Konferencja Zastosowań Matematyki 17-24 September 2002, Zakopane, Polska.

  5. Cebrat S., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Mackiewicz D. 2002, The role of intergenic sequences in the genomes of sexually reproducing organisms. Polish-Japanese Bilateral Seminar on Bioinformatics 24-25 June 2002, Poznań, Polska.

  6. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Polak N., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Tworzenie tablic mutacji dla genomów prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 210

  7. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Polak N., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Presja mutacyjna w genomach prokariotycznych. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  8. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Mackiewicz D., Nowicka A., Dudkiewicz M., Łaszkiewicz A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, From mutational pressure to structure of genomes. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 197-198

  9. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Testowanie tablic mutacji dla genomów prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 210-211

  10. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Speciation effect in the Penna model. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  11. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Jak przyłapać starość na gorącym uczynku, czyli symulacje Monte Carlo dynamiki populacji. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  12. Łaszkiewicz A., Szymczak S., Cebrat S. 2002, Higher mortality of the youngest organisms predicted by the Penna ageing model. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  13. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Rearanżacje pomiędzy nicią wiodącą i opózniającą w genomach bakteryjnych. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  14. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Wpływ historii genów na strukturę drzew filogenetycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 212

  15. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Kodujące właściwości genomu drożdży Saccharomyces cerevisiae. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 213

  16. Mackiewicz P., Łaszkiewicz A., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Ocena modeli ewolucji sekwencji nukleotydowych do określania odległości między sekwencjami. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 209-210

  17. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Przyczyny różnic w tempie dywergencji genów bakterii. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 211

  18. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Kowalczuk M., Banaszak J., Cebrat S. 2002, Symetria procesów rekombinacyjnych w genomach prokariotycznych. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 213

  19. Mackiewicz P., Mackiewicz D., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Wysokie tempo dywergencji blisko spokrewnionych genomów bakterii. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  20. Mackiewicz D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2002, Tempo translokacji genów między nićmi DNA. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 212

  21. Nowicka A., Dudek M. R. 2002, Wpływ zmiennych warunków środowiska na strukturę genetyczną gatunków. Konferencja naukowa "Biotechnologia w Polsce" 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  22. Nowicka A., Duda A., Dudek M. R. 2002, Effect of variable surrounding on species creation. Conference on Mathematical Modelling of Population Dynamics 24-28 June 2002, Będlewo, Polska.

  23. Stauffer D., Dudkiewicz M., Cebrat S. 2002, Geneza paralogów w genomach haploidalnych. Konferencja naukowa ”Biotechnologia w Polsce” 25-28 September 2002, Gdańsk, Polska.

  24. Stauffer D., Dudkiewicz M., Cebrat S. 2002, Redundancja informacji w genomach. XXXVIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego 18-22 September 2002, Wrocław, Polska. Streszczenia pp. 214

  25. Team of Department of Genomics . 2002, Approximation of the coding capacity of genomes. Partners in Project FP6. November, Aalborg, Denmark. Abstract Bio 002 pp. 32-33

2001


  1. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Szczepanik D., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zastosowanie proteomów do badania odleglości filogenetycznej między bakteriami. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 103

  2. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, ORFy krótsze niż 100 kodonów w genomie Saccharomyces cerevisiae. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 107

  3. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Precyzyjne prawo ewolucji genomów. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 60

  4. Kurdziel A., Cebrat S. 2001, Rola sprzężeń genetycznych w komputerowo symulowanych populacjach. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 62

  5. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Łaszkiewicz A., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Replication Associated Mutational Pressure Generating Long Range Correlation in DNA. Conference: “Horizons in Complex Systems” 5-9 December 2001, Messina, Italy.

  6. Mackiewicz P., Szczepanik D., Nowicka A., Polak N., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zróżnicowane tempo zabijania genów w zależności od ich położenia na chromosomie. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 118

  7. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Szczepanik D., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Number and coding probability of short ORFs in the Saccharomyces cerevisiae genome. The 20th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 26-31 August 2001, Prague, Czech Republic. Yeast 18 pp. 106

  8. Mackiewicz P., Szczepanik D., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Szacowanie liczby genów w genomach prokariotycznych. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 112

  9. Nowicka A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Presja mutacyjna w genomie Borrelia burgdorferi. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 114

  10. Szczepanik D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Smolarczyk K., Dudek M. R., Cebrat S. 2001, Zróżnicowane tempo ewolucji genów w genomach bakteryjnych XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 11-13 June 2001, Poznań, Polska. Streszczenia pp. 118

2000


  1. Dudkiewicz M., Szczepanik D., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Application of proteomes for investigation of phylogenetic distance between bacteria. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-2 pp. 151

  2. Gierlik A., Mackiewicz P., Szczepanik D., Kowalczuk M., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Effect of selection pressure on the asymmetry of coding and non-coding sequences. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-4 pp. 152

  3. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Thousands of noncoding ORFs in the yeast genome. Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting 25-30 July 2000, Seattle, USA. Book of Abstracts S50 pp. 61

  4. Kowalczuk M., Dudkiewicz M., Nowicka A., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Simulation of asymmetric mutation pressure in Borrelia burgdorferi genome. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-5 pp. 152

  5. Mackiewicz P., Szczepanik D., Gierlik A., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, One thousand genes less in the yeast genome? The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-1 pp. 151

  6. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Gierlik A., Szczepanik D., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, No mystery of ORFans in Genomics - Generation of ORFans in the Antisense of Coding Sequences. The Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, BGRS 7-11 August 2000, Novosybirsk, Russia. Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure vol. 2 pp. 38-41
    [Download]

  7. Nowicka A., Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Asymmetry of the nucleotide composition of the leading and retarding strand. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-6 pp. 152

  8. Szczepanik D., Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Dependence of gene evolution rate on location on the chromosome in eubacteria. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, G/P-3 pp. 151

  9. Wróblewska H., Mackiewicz P., Gierlik A., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 2000, Number of genes in prokaryotic genomes. The 24th Congress of the Polish Society of Microbiologists 12-15 September 2000, Białystok, Polska. Med. Sci. Monit. 6, Suppl. 3, C/P-1 pp. 110

1999


  1. Bartkowiak A., Cebrat S., Mackiewicz P. 1999, Some statistical problems arising when investigating DNA sequences. Second European Conference on Highly Structured Stochastic Systems 14-18 September 1999, Pavia, Italy. Book of Abstracts pp. 19-21

  2. Dudkiewicz M., Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Logic structure of DNA coding sequences. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  3. Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Szczepanik D., Dudkiewicz M., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Distribution of coding sequences on the surface of torus. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  4. Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Wróblewska H., Nowicka A., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Correlation in coding sequences of different genomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  5. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Gierlik A., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of nucleotide composition of prokaryotic chromosomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  6. Kowalczuk M., Gierlik A., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Is there replication-associated mutational pressure in the Saccharomyces cerevisiae genome? The 19th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 25-30 May 1999, Rimini, Italy. Current Genetics, 35(3-4) pp. 225

  7. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of coding sequences in Borrelia burgdorferi genome. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  8. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Szczepanik D., Stojek E., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Asymmetry of coding properties of prokaryotic chromosomes. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

  9. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, How were noncoding ORFs generated in the yeast genome? The 19th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 25-30 May 1999, Rimini, Italy. Current Genetics, 35(3-4) pp. 226

  10. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Cieślakiewicz D., Borkowska J., Dudek M. R., Cebrat S. 1999, Graphic representation of coding DNA sequences - spiders and cracknels. The 13th Max Born Symposium 26-30 May 1999, Wrocław, Polska.

1998


  1. Cebrat S., Dudek M. R., Gierlik A., Kowalczuk M., Mackiewicz P. 1998, Effect of replication on the third base of codons. The 11th Marian Smoluchowski Symposium on Statistical Physics 1-5 September 1998, Zakopane, Polska.

  2. Cebrat S., Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R. 1998, Asymmetry of nucleotide composition of bacterial chromosomes. XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 155

  3. Fita M., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1998, Mystery of Orphans revisited. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 18

  4. Gierlik A., Nowicka A., Cebrat S. 1998, How replication-associated mutational pressure affect coding and noncoding sequences? The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 17

  5. Gierlik A., Borkowska J., Cieślakiewicz D., Cebrat S. 1998, Types of nucleotide substitutions introduced by mutational pressure into coding and noncoding sequences. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 18

  6. Gierlik A., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, Is transcription the main reason of asymmetry of DNA molecule? XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 156

  7. Kowalczuk M., Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, The number of protein coding ORFs in Saccharomyces cerevisiae genome. XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 155

  8. Kowalczuk M., Gierlik A., Mackiewicz P., Cebrat S. 1998, Using the effect of mutational pressure for mapping the origin and the terminus of replication of prokaryotic genomes. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 3

  9. Mackiewicz P., Stojek E., Szczepanik D., Cebrat S. 1998, Aminoacid composition of peptide depends on the location of gene on chromosome. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 16

  10. Mackiewicz P., Gierlik A., Kowalczuk M., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, How amino acid composition of proteins depends on location of their genes on chromosome? XIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego 22-25 September 1998, Warszawa, Polska. J. Appl. Genet. 39A pp. 156

  11. Mackiewicz P., Dudek M. R., Cebrat S. 1998, Statistical significance of the asymmetry introduced by mutational pressure. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 17

  12. Mackiewicz P., Wiszniowska T. 1998, Thickness and structure of dental enamel in the selected recent and fossil species of mammals. The 6th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 34

  13. Schneider J., Cebrat S., Stauffer D. 1998, Why do women live longer than men? A monte Carlo simulation of Penna models with X and Y chromosomes. The 5th International Conference Mathematical Population Dynamics , Zakopane, Polska.

1997


  1. Cebrat S., Dudek M. R., Mackiewicz P., Kowalczuk M., Fita M. 1997, Asymmetry of coding versus noncoding strands of protein coding sequences. The 9th International Genome Sequencing and Analysis Conference 13-16 September 1997, Hilton Head, USA.

  2. Cebrat M., Kanczewska J., Cebrat S. 1997, The role of silent mutations in CpG sequences in the human p53 gene. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 23

  3. Cebrat S., Dudek M. R., Mackiewicz P. 1997, The number of coding ORFs in Saccharomyces cerevisiae genome and the mystery of orphans. The 18th Int. Conf. Yeast Genetics Mol. Biol. , Stellenbosch, South Africa. Yeast 13, S262

  4. Cebrat S., Dudek M. R. 1997, Compensation of coding trends in yeast genome. Middle European Cooperation in Statistical Physics April 1997, Szklarska Poręba, Polska.

  5. Fita M., Kowalczuk M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1997, Estimation of the number of genes in the yeast genome - the explanation of the paradox of orphans. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 25

  6. Kowalczuk M., Fita M., Mackiewicz P., Cebrat S. 1997, The asymmetry of the sense versus antisense strands of coding sequences in Saccharomyces cerevisiae genome. The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 8

  7. Mackiewicz P., Kowalczuk M., Fita M., Cebrat S. 1997, Have genes generated new genes in antisense? The 5th International Students’ Scientific Conference , Gdańsk, Polska. Book of Abstracts pp. 34

1996


  1. Cebrat S., Dudek M. R. 1996, Symmetry in chromosome fractal organization and DNA domain structure. The 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing 17-21 September 1996, Kraków, Polska. Proceedings of the 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing pp. 371-374

  2. Cebrat S., Dudek M. R. 1996, Symmetry in DNA domains of Yeast Chromosomes. The 8th Joint EPS-APS Int. Conference on Physics Computing 17-21 September 1996, Kraków, Polska.

1995


  1. Cebrat S., Dudek M. R. 1995, Analiza korelacji dalekozasięgowych w sekwencjach chromosomów drożdżowych. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 25

  2. Cebrat S., Maliszewska-Fiszer Ł. 1995, Mutacje somatyczne w genie p53 człowieka. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 153

  3. Cebrat S., Dudek M. R. 1995, Klasyfikacja otwartych ramek odczytu. XII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetycznego , Szczecin, Polska. J. Appl. Genet. 36A pp. 24

Pliki Cookies

Meritum

Archive

Webmail SQ

Webmail RC

Owncloud